Целью научно-исследовательской деятельности института является создание системы подготовки научных кадров на уровне мировых квалификационных требований, разработка инноваций, расширение масштабов и увеличение объема финансирования научно-исследовательских работ, интеграции научной, образовательной, инновационной  и физкультурно-спортивной деятельности, эффективное использование научного потенциала для развития отрасли.

Задачи:

- осуществление подготовки научных кадров высшей квалификации;

- проведение фундаментальных, прикладных и поисковых исследований, определяющих общий потенциал института и ускоренное внедрение результатов работ в практику;

- развитие различных форм научного сотрудничества с другими вузами, с организациями, предприятиями и научными институтами в области физической культуры и спорта;

- обогащение учебного процесса результатами новейших научных исследований;

практическое ознакомление студентов института с постановкой научных исследований и привлечение их к научно-исследовательской, опытно-экспериментальной работе;

- обеспечение соответствия показателей научно-исследовательской деятельности ФГБОУ ВПО ЧГИФКиС аккредитационным критериям, предъявляемым к вузам;

- привлечение инвестиций для развития научно-исследовательской деятельности и укрепление научной инфраструктуры вуза.